Yo he usado los 3; Nico FTP, Cute FTP y Smart FTP por ese orden.
Cualquier cliente FTP va bien, pero yo me quedo con Smart FTP de lejos. Es el que menos errores y más velocidad me ha mostrado, a parte de tener muchas más opciones (no por ello más complicado) que los otros dos.
El Nico FTP lo descartaría porque, si no recuerdo mal, no tiene Drag & Drop (no puedes arrastrar los archivos desde una ventana de tu ordenador, al FTP).