-- Edito (y lo subo aki arriba) --
¿Qué panel tienes? esque no todos los paneles tienen el sistema igual, o directamente no lo tienen y tendrias que hacerlo desde SSH
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ya lo dije en un mensaje de otro post pero bueno

0,30 * * * * php: http://www.tuweb.es/miarchivo.phpEn caso de que te pida dias, horas minutos, introduce asi:
minutos: 0,30 (lo ejecutara cuando sean las xx:00 y las xx:30
horas: * (a cualquier hora)
dia: * (todos los dias)
mes: * (todos los meses)
dia de la semana: * (todos los lunes, martes, miercoles...)
comando: "php :http://www.tuweb.es/miarchivo.php"   (sin comillas)

con eso ya te basta, ah pero necesitas hacer el .php que haga un TRUNCATE

bases de datos limpias o tablas limpias?

Querrás decir que limpie las tablas...

mysql_query("TRUNCATE TABLE `enlinea`"); // esto vaciaria la tabla "enlinea"

:S, creas un archivo de conexion con mysql_conect() y mysql_select_db() y ya esta [no tengo tiempo de hacertelo, sorry, busca en cualquier mc]