Para limpiar la pantalla en Windows, usariamos el metodo system, antes de nada incluimos la libreria:
#include <cstdlib>
y despues en el codigo, añadiriamos esto:
system("cls");
Linux:
system("clear");
Con la misma libreria, y el ultimo metodo que se podria utilizar en ambos:
char a[5]={27,'[','2','J',0};
cout << a;
Libreria en C: <stdlib.h>