Hola, hoy veré que servidor web, de los dos mas usados, prefiere PHPeros.
¿Que es IIS?
IIS significa "Internet Information Services"
Windows lo trae adicionado, es un servidor que, puedes activar así (Windows 7)
Panel de Control >> Programas y características>> Activar o desactivar características de Windows >> Activar Internet Information Services>> Aceptar.
Es muy parecido apache, ya que cumple la misma función, lo unico diferente es que siempre esta activo sin tener que usar SVC.
Actualmente esta en la versión 7.0.
Un dato: LO UTILIZA UOL HOST

¿Que es Apache?
Simplemente, el servidor mas popular en todo el mundo, y, aunque windows no lo traiga pre-instalado, ¡Linux sí!
Te lo puedes descargar desde aquí
Simplemente, le lleva una gran ventaja a IIS, además, la mayoría de la gente que conoce Apache, no conoce IIS
Un dato: ¿PUES CUAL? ES EL MAS USADO

Yo me voy por apache

Pues IIs porque a ese manejas asp y le puedes poner igual php