Buenas,
Pues como te han dicho por ahí es con doble conexion y dónde vayas a hacer las querys se identifica el socket de conexión me explico con un ejemplo.
<?php
$socketsql1 = mysql_connect("localhost","root","pwd");
$socketsql2 = mysql_connect("192.168.1.25","root","pwd");
@mysql_select_db("dbname1",$socketsql1);
@mysql_select_db("dbname2,$socketsql2);
?>
y para el query...
<?php
mysql_query("SELECT * FROM tabla",$socketsql1); // para el primero
mysql_query("SELECT *FROM tabla", $socketsql2); // para el segundo
?>
Espero haber aclarado tu duda ^^