El que siempre recomiendo de PHP
Título: La biblia de PHP5 La biblia de PHP5
Autor: John Coggeshall
Editorial: Anaya Multimedia
Seguridad para aplicaciones de escritorio (Principalmente trata de C y ensamblador para i386)
Título: Hacking: The Art of Exploitation, 2nd Edition
Autor: Jon Erickson
Editorial: No recuerdo :S
Seguridad web (Trata PHP, ASP, JS, Java Applets, MySQL y demás tecnologías web)
Título: The Web Application Hacker's Handbook: Detecting and Exploiting Security Flaws
Autores: Dafydd Stuttard y Marcus Pinto
Editorial: Wiley
Los tres son muy buenos pero para los interesados en la seguridad informática en general (no solo la seguridad web) los dos últimos son muy recomendables. El de seguridad web aún no lo acabé pero desde luego por lo que llevo leído no quitan las ganas y esta declarado por la comunidad en general como uno de los mejores libros de esta temática.
Saludos!